En Harvard Medical School utilizan los selectores de colonias QPix para mapear redes de interacciones macromoleculares para ayudar a comprender la relación entre fenotipo y genes.

El reto

En el Center for Cancer Systems Biology (CCSB) del Dana-Farber Cancer Institute, utilizan estrategias experimentales e informáticas para desvelar interacciones biológicas complejas. Utilizando una gran cantidad de plataformas de tecnología y herramientas bioinformáticas, han generado mapas de interacciones proteína-proteína, o “interactoma”, de diversos organismos. Las interacciones proteína-proteína binarias de alta calidad se generan empleando variantes de metodologías de doble híbrido en levadura combinadas con validación usando métodos ortogonales in vivo e in vitro. Los datos experimentales no sesgados se pueden integrar con el análisis informático e investigación de la literatura científica para ayudar en sus descubrimientos.

La solución

El sistema QPix™ 460 proporciona esta capacidad experimental mediante el cribado y selección de bibliotecas de microorganismos de alto rendimiento. El sistema QPix los ayuda a incrementar tanto la velocidad como el volumen con el que se descubren las interacciones proteína-proteína, lo que les permite ampliar rápidamente los mapas de interactomas de alta calidad.

Selectores de colonias microbianas QPix

Detalles

Productos utilizados

Los sistemas QPix serie 400 de selectores de colonias microbianas le ofrecen la opción única de detectar simultáneamente colonias y cuantificar marcadores fluorescentes en un paso previo al cribado antes de la selección. Nuestros sistemas QPix se utilizan en todo el mundo en más de 600 instalaciones en institutos de investigación, instalaciones de secuenciación y compañías biotecnológicas y farmacéuticas. La robótica de QPix se ha hecho una muy buena reputación por su fiabilidad y exactitud en centros de secuenciación durante el proyecto Genoma Humano.

Estos sistemas, que son más que simples selectores de colonias, permiten a los científicos:

• Automatizar los flujos de trabajo desde el muestreo y expansión a la selección.
• Seleccionar siempre las colonias correctas.
• Gestionar de forma eficiente poblaciones grandes y diversas para: expresión de proteínas, investigación en biocombustibles, evolución de enzimas, despliegue de fagos, secuenciación de ADN y generación y gestión de bibliotecas.

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