El reto
El enfoque de Inscripta es popularizar en el mundo la edición adaptable del genoma ofreciendo una plataforma integral formada por software, instrumento, reactivos y consumibles para permitir avanzar en soluciones de ingeniería que sean más rápidas, sencillas y rentables para sus clientes. El resultado de la plataforma de edición del genoma Onyx de Inscripta es un pool de células que contiene hasta 10 000 ediciones únicas que requiere seleccionar grandes cantidades de colonias (p. ej., 1000-10 000) en flujos de trabajo de cribado en placas de microtitulación de alto rendimiento.
La solución
Las plataformas QPix y Onyx son herramientas sinérgicas que permiten a los clientes generar y cribar de forma efectiva diversidad fenotípica para hacer posible soluciones satisfactorias de bioeconomía para las compañías de biología sintética de última generación.
Selectores de colonias microbianas QPix
Productos utilizados
Los selectores de colonias microbianas QPix™ serie 400 combinan el análisis inteligente de imágenes con la automatización precisa para un cribado rápido y eficiente de librerías grandes. La capacidad para seleccionar hasta 3000 colonias por hora optimizará su flujo de trabajo. Además del cribado microbiano, el sistema automatiza varios procesos de preparación de muestra y manipulación de placas, tales como transferencia de cultivo líquido bacteriano y siembra en placa o agar. Con una serie de herramientas de ensayo y seguimiento de datos, el software QPix optimiza el control y manejo de procesos complejos y reiterativos.
Los resultados
Figura 1: En esta gráfica se representan los principales sobreproductores de lisina que se generaron con la plataforma Onyx y colonias seleccionadas con el sistema QPix. Las ediciones genómicas ventajosas se combinaron rápidamente en 3 rondas de ingeniería para producir una cepa mejorada con una mejora de 14 000 veces en el título de lisina con respecto a la cepa E. coli natural.