En la Universidad de Edimburgo utilizan el selector de colonias QPix para ampliar la escala de fabricación de ADN

El reto

En Edinburgh Genome Foundry (EGF) fabrican material genético para sus clientes utilizando una plataforma robótica completamente automatizada, mediante la creación y modificación de cadenas de ADN de hasta un mega de pares de bases de longitud. Estas construcciones de ADN se utilizan para equipar a las células o a organismos completos con funcionalidades nuevas o mejoradas, tales como programación de células madre para su uso en medicina personalizada, producción de bacterias que detectan enfermedades o aumento del rendimiento de cultivos de biocombustibles.

Para lograr un mayor rendimiento de las muestras con un seguimiento exacto de muestras y datos, EGF necesitaba un sistema de selección de colonias automático que también fuera capaz de sembrar mediante estrías múltiples muestras en placas en un formato conforme a SBS compatible con la automatización. Adicionalmente, este sistema tenía que ser capaz de integrar completamente su flujo de trabajo automatizado ya existente. Esto requería modificaciones del hardware y software que permitan el acceso a brazos robóticos de otros fabricantes para manipular y dispensar muestras a otros instrumentos integrados en el flujo de trabajo.

La solución

Selectores de colonias microbianas QPix

Detalles

Productos utilizados

Los sistemas QPix serie 400 de selectores de colonias microbianas le ofrecen la opción única de detectar simultáneamente colonias y cuantificar marcadores fluorescentes en un paso previo al cribado antes de la selección. Nuestros sistemas QPix se utilizan en todo el mundo en más de 600 instalaciones en institutos de investigación, instalaciones de secuenciación y compañías biotecnológicas y farmacéuticas. La robótica de QPix se ha hecho una muy buena reputación por su fiabilidad y exactitud en centros de secuenciación durante el proyecto Genoma Humano.

Estos sistemas, que son más que simples selectores de colonias, permiten a los científicos:

• Automatizar los flujos de trabajo desde el muestreo y expansión a la selección.
• Seleccionar siempre las colonias correctas.
• Gestionar de forma eficiente poblaciones grandes y diversas para: expresión de proteínas, investigación en biocombustibles, evolución de enzimas, despliegue de fagos, secuenciación de ADN y generación y gestión de bibliotecas.

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Los resultados

Con la capacidad de sembrar hasta 200 muestras o seleccionar hasta 3​000 colonias en una hora, el sistema QPix Select-HT permite el muestreo de alto rendimiento necesario para la entrega a tiempo de productos a sus clientes. Cada proceso tiene un seguimiento de la muestra y gestión de los datos fiables, lo que permite a EGF gestionar de forma eficiente los datos de las muestras durante todo el flujo de trabajo automatizado. La integración del sistema en un flujo de trabajo completamente automatizado también reduce las horas de trabajo de los empleados necesarias para ejecutar el sistema, reduciendo, por tanto, los costes económicos de cada proyecto de EGF. La estrecha colaboración entre el equipo de AWES de Molecular Devices y la Edinburgh Genome Foundry se tradujo en una solución eficiente para las necesidades específicas de su flujo de trabajo, lo que permite a EGF cumplir con su objetivo de una plataforma completamente automatizada para el ensamblaje del ADN.

Descargar el estudio de caso completo (versión PDF) >>

Ver QPix en acción en Edinburgh Genome Foundry

https://share.vidyard.com/watch/kVYfXTZ2tpo2cTJ3FAazqn

Referencias

Wevers, N.R. et al. High-throughput compound evaluation on 3D networks of neurons and glia in a microfluidic platform. Nature Scientific Reports 6, Número de artículo: 38856 (2016).

Junaida A. et al. An End-User Perspective on Organ-on-a-Chip: Assays and Usability Aspects. Current Opinion in Biomedical Engineering. Artículo en prensa (2017).