Software de análisis de imágenes IN Carta
Proporciona resultados cuantitativos sólidos a partir de imágenes biológicas complejas y conjuntos de datos
Vaya rápidamente y de forma fiable del ensayo a los datos con los sistemas de adquisición de imágenes ImageXpress y el software IN Carta
El software de análisis de imágenes IN Carta® resuelve problemas de análisis de imágenes complejos utilizando una avanzada inteligencia artificial (IA) que transforma las imágenes en resultados que se pueden interpretar con facilidad. Los flujos de trabajo fáciles de usar le ayudan a obtener con más rapidez respuestas a partir de experimentos 2D, 3D y 4D. Con la integración de nuestra aplicación Custom Module Editor usted puede definir protocolos de análisis de imágenes altamente personalizados que le permitan obtener resultados sólidos (incluso para ensayos complejos) y visualizar, revisar e interaccionar rápidamente con los resultados del análisis. Deje que el software IN Carta haga el trabajo pesado para que usted pueda centrarse en su investigación.
Potente
Los flujos de trabajo guiados y el procesamiento por lotes adaptable incrementan la productividad y reducen el tiempo de respuesta. Los experimentos se pueden configurar rápidamente realizándose en paralelo el análisis de múltiples pocillos.
Perspicaz
El aprendizaje automático le ayuda a aprovechar más información y aumentar la exactitud en el análisis de datos de cribado de alto contenido para permitir realizar nuevos descubrimientos con confianza.
Intuitivo
La moderna tecnología vanguardista y basada en la experiencia del usuario minimizan la curva de aprendizaje del software y elimina barreras a la productividad.
Software de análisis de imágenes IN Carta
Características
Aprendizaje profundo
Mejore la especificidad de sus flujos de trabajo de análisis de imágenes con el módulo SINAP. SINAP se basa en el análisis de imágenes basado en el aprendizaje profundo, lo que da como resultado una segmentación sólida de prácticamente cualquier estructura biológica.
Comience con una lista de trabajo
Navegue hasta un directorio principal y llene su lista de trabajo con conjuntos de datos de imágenes de interés o simplemente utilice la búsqueda para encontrarlas.
Análisis de datos basado en IA
Aproveche la potencia del aprendizaje automático sin ser analista de datos. Identifique y cuantifique cambios fenotípicos en un flujo de trabajo fácil de usar. Explore sus datos y revele información de conjuntos de datos complejos. Descubra nuevos e inesperados fenotipos con algunos clic de ratón.
Personalización
Explore y revise imágenes de experimentos, genere protocolos de análisis de imágenes de diferente complejidad y añada clasificación de datos a demanda. Visualice los resultados del análisis utilizando la vinculación de datos de 360º entre las imágenes, tabla de datos y gráficos.
Análisis 3D
La aplicación 3D de Custom Module Editor proporciona una flexibilidad sin precedentes en la segmentación de estructuras biológicas complejas. Los conjuntos de datos de imágenes se pueden adquirir en 3D o 4D (lapso de tiempo 3D) y se pueden desarrollar rutinas de análisis de imágenes en un flujo de trabajo guiado.
Análisis por lotes y monitorización
Analice varios experimentos en modo análisis por lotes con uno o más protocolos de análisis. Monitorice el estado de todas las tareas enviadas y supervise su progresión en tiempo real.
Flexi-Protocol
La aplicación Flexi-Protocol permite crear protocolos de análisis personalizados de distinta complejidad añadiendo tantos pasos de análisis como sean necesarios. Cada paso del análisis puede contener la operación de preprocesamiento de imágenes y posprocesamiento de máscara de objeto para adaptarse mejor a un ensayo específico. Los paneles rediseñados de análisis y visualizador de imágenes pueden expandirse o contraerse dependiendo de en qué sea necesario centrarse.
- Simple o complejo: Cree cualquier protocolo de análisis que necesite para el ensayo de interés. Segmente y extraiga mediciones a partir de cualquier número de canales
- Personalizado: Defina la jerarquía de objetivos en el protocolo mediante la vinculación de objetivos. Utilice la opción de medición personalizada para calcular mediciones adicionales de cualquier objetivo biológico.
- Convincente: Aproveche la opción de segmentación con aprendizaje profundo a cualquiera de los pasos de análisis. Las máscaras objetivo se pueden combinar empleando operaciones lógicas.
- Fácil de usar: La interfaz de usuario intuitiva con paneles dinámicos permite el desarrollo de protocolos focalizados.
- Ayuda solo a un clic: Ayuda contextual fácilmente accesible con una guía de usuario interactiva con función de búsqueda.
IN Carta SINAP
SINAP es un módulo que utiliza algoritmos de aprendizaje profundo para mejorar la exactitud y fiabilidad de los ensayos de cribado de alto contenido en el primer paso del proceso de análisis: la segmentación. Proporciona mejor detección del objeto que los métodos tradicionales de análisis de imágenes. Los modelos de aprendizaje profundo se pueden adaptar fácilmente en una herramienta fácil de usar, de modo que pueda segmentarse cualquier objeto biológico nuevo de forma eficaz. La información cuantitativa extraída de objetos segmentados es más exacta, por lo que los errores no se propagan a lo largo del proceso de análisis.
Con SINAP, la segmentación ya no es un problema.
- Exacto: el aprendizaje profundo puede mantener la exactitud en muestras difíciles de segmentar, como células confluentes, muestras con baja relación señal/ruido e imágenes de luz transmitida.
- Fiable: los modelos SINAP pueden dar cuenta de una elevada variabilidad fenotípica.
- Flexible: un único flujo de trabajo puede abordar varias aplicaciones y modalidades de adquisición de imágenes.
- Accesible: el modelo entrenado aprende a segmentar a partir del trazo del científico en la imagen, en lugar de pedir al usuario que genere un nuevo modelo y optimice múltiples parámetros.
Los modelos de aprendizaje profundo SINAP personalizados segmentan regiones específicas (cuerpo entero, cabeza, ojos, cerebro) de un embrión de pez cebra en imagen de luz transmitida. Cortesía de Guo Lab, UCSF
IN Carta Phenoglyphs
El módulo de software IN Carta® Phenoglyphs™ utiliza una combinación única de aprendizaje automático supervisado y no supervisado para cuantificar cambios fenotípicos. Usando muchos cientos de rasgos celulares que se pueden analizar simultáneamente, se crea un perfil fenotípico completo que se puede aplicar a lo largo de un flujo de trabajo de cribado completo. Este método con variables múltiples de clasificación proporciona una caracterización exacta de poblaciones de objetos que permiten al usuario resolver cambios fenotípicos sutiles inducidos por tratamientos farmacológicos o modificaciones genéticas. Se puede utilizar en numerosas dianas biológicas, como organoides, células, esferoides y más.
Clasificación de esferoides formados a partir de células HCT116. Los esferoides se segmentaron en función de las imágenes de campo claro usando SINAP. Adicionalmente, se aplicó tinción de contraste con Hoechst 33342, calceína AM y MitoTracker Red para visualizar los núcleos, las células vivas y las mitocondrias, respectivamente.
- Completo: un enfoque basado en los datos que comienza con un agrupamiento no supervisado para encontrar patrones en los datos y resaltar subpoblaciones sin conocimiento previo de qué fenotipos pueden encontrarse.
- Sólido: el algoritmo de aprendizaje automático específico identifica el conjunto óptimo de características descriptivas para evitar el sobreajuste del modelo de clasificación resultante.
- Flujo de trabajo optimizado: la clasificación se realiza simplemente confirmando o corrigiendo las predicciones del algoritmo hasta que aprenda el comportamiento correcto.
IN Carta Custom Module Editor 2D y 3D
- Cree un análisis sencillo personalizado paso a paso
- Ajuste la segmentación y clasificación de objetos
- Encuentre objetos localizados dentro de compartimentos biológicos definidos
- Notifique solo las medidas necesarias para un ensayo de interés
- Analice los datos de adquisición de imágenes de células vivas
- Segmentación 3D real (solo aplicaciones 3D)
- Sólida reconstrucción de segmentación 2D en volumen para ensayos 3D (solo aplicaciones 3D)
Ejemplo de segmentación de células HCT116 que forman un esferoide segmentado en Custom Module Editor 3D y visualizado en el visor 3D
Sistema de adquisición de imágenes de alto contenido ImageXpress® Confocal HT.ai
Potentes fuentes de luz multiláser, un módulo de disco confocal de penetración profunda en el tejido, objetivos de inmersión en agua y software de análisis con un moderno aprendizaje automático
- Ideal para ensayos con células y 3D de gran complejidad
- Láseres de alta intensidad, de siete canales, que generan imágenes más brillantes con una relación señal/fondo más alta
- Tecnología de disco confocal giratorio para una penetración más profunda en el tejido que proporciona imágenes más nítidas con mejor resolución
- Objetivos de inmersión en agua que permiten cuadruplicar la señal en tiempos de exposición más bajos para una mayor sensibilidad y claridad de la imagen
Analítica avanzada basada en la nube StratoMineR
Genere datos claros y profundos a partir de conjuntos de datos complejos
Los flujos de trabajo potentes e intuitivos permiten a los usuarios transferir datos de adquisición de imágenes de alto contenido directamente a StratoMineR, donde se utilizan para generar visualizaciones ricas e interactivas utilizando métodos avanzados de extracción de datos. Cuando se utiliza con el software de análisis de imágenes IN Carta proporciona resultados cuantitativos sólidos de conjuntos de datos e imágenes biológicas complejas utilizando inteligencia artificial avanzada. Utilice todos sus datos de alto contenido para descubrir, caracterizar y analizar fenotipos.
Recursos más recientes
¿Cómo podemos ayudarle a avanzar en su próximo gran descubrimiento?
Nuestros equipos altamente calificados están en primera línea con nuestros clientes, realizando demostraciones remotas o in situ de productos, seminarios web y más para ayudarle a resolver los difíciles desafíos de su investigación. ¿Cómo podemos ayudarle hoy?
Me gustaría...
Recursos del software de análisis de imágenes IN Carta
Explore nuestro catálogo para la adquisición de imágenes de alto contenido
Soluciones de adquisición y análisis de imágenes de alto contenido que oscilan desde microscopía digital automatizada hasta sistemas de adquisición de imágenes confocales de alto contenido con objetivos de inmersión en agua y tecnología exclusiva de disco giratorio.