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Sistema automático de cribado microbiano capaz de seleccionar hasta 3​000 colonias por hora

 

El selector de colonias microbianas QPix® la mejor tecnología de selección de colonias de su clase para aliviar los cuellos de botella y realizar cribados de forma rápida, exacta y eficiente de bibliotecas genéticas masivas. El software intuitivo y fácil de usar guía a los usuarios a través de la configuración de los ciclos de selección de colonias en los que la robótica de precisión selecciona siempre las colonias correctas. Además del cribado microbiano, el sistema automatiza varios procesos de preparación de muestra y manipulación de placas, tales como transferencia de cultivo líquido bacteriano y siembra en placa o agar. 

Los datos se registran automáticamente en la base de datos del aparato, lo que proporciona a los usuarios una pista de auditoría completa y seguimiento de la muestra, garantizando que nunca se pierdan datos. Nuestra serie modular y ampliable de selectores de colonias permite a grupos de cualquier tamaño aumentar la exactitud y el rendimiento de sus flujos de trabajo, permitiendo a la vez incrementar el rendimiento en el futuro.

  • Amplitud Icono

    Identifique colonias con el fenotipo deseado

    Los selectores de colonias QPix admiten una amplia variedad de microorganismos y diferentes modalidades de selección, como intensidad de fluorescencia, selección azul/blanco, tamaño y proximidad y zona de inhibición.

  • Seleccione Icono

    Seleccione colonias de forma eficiente

    Un juego de sonda específica de organismo y sensor de agar garantizan una selección eficiente. El sistema proporciona una selección eficiente >98 %, lo que le permite disponer de tiempo con confianza.

  • Esterilidad Icono

    Mantenga la esterilidad

    Hay disponible una serie de características de esterilidad, incluido un proceso de luz UV para desinfectar el interior del instrumento, así como el lavado y secado con halógeno de las sondas.

Anatomía de un sistema QPix

Características

  • Eficiente Icono

    Sondas específicas de organismo

    Las sondas de diferentes formas y áreas de selección maximizan la eficiencia para E. coli, fagos y levadura. Las sondas específicas de siembra garantizan una distribución uniforme del cultivo líquido sobre el agar.

  • Múltiples selecciones Icono

    Modos múltiples de adquisición de imágenes

    Las colonias se pueden seleccionar en función de parámetros preespecificados usando luz blanca, fluorescencia y color. El uso de filtros permite aplicaciones como el cribado de colonias blancas/azules.

  • Ahorro de tiempo Icono

    Siembra y extensión

    Se puede realizar la siembra y estriado automático de 96 muestras en 30 minutos, lo que permite disponer de más tiempo.

  • Optimizar Icono

    Replicación, cuadrícula y selección de positivos

    La manipulación y el seguimiento automatizados de placas optimizan el ensayo posterior y la gestión de las muestras. Los selectores de colonias QPix proporcionan funciones flexibles de replicación y cuadriculación de placas y selección de colonias positivas.

  • Eficiente Icono

    Detección de agar

    El sensor ultrasónico de la altura del agar detecta diferencias en la altura debidas al volumen variable de vertido, lo que permite la máxima eficiencia de la selección.

  • Automatización Icono

    Opciones de automatización adaptables*

    El modelo QPix HT es una solución compatible con robots con una plataforma modular. El equipo de Soluciones Avanzadas de Ingeniería para Flujos de Trabajo puede adaptar un selector de colonias con una serie de servicios personalizados.

*El precio, el plazo de entrega y las especificaciones pueden variar en función de los requisitos técnicos acordados mutuamente. Los requisitos de la solución pueden causar ajustes en el rendimiento estándar.

Automatice su flujo de trabajo con el selector de colonias QPix

La selección de colonias es un paso esencial en la investigación biomédica, ya que los científicos aíslan con frecuencia clones microbianos para producir en masa ADN o proteínas para su uso en diferentes aplicaciones posteriores. Tradicionalmente, la selección de colonias se realiza manualmente, empleando puntas de pipeta o asas de inoculación estériles, lo que supone un proceso lento, laborioso y largo. Los selectores automáticos de colonias no solo harán más rápido el proceso completo, sino que los resultados son más uniformes y fiables.

ADQUISICIÓN DE IMÁGENES
CAPACIDAD DE SELECCIÓN
CRITERIOS DE SELECCIÓN DE COLONIAS
SELECCIÓN Y SELECCIÓN REGIONAL
SEGUIMIENTO CON CÓDIGO DE BARRAS
REDISPOSICIÓN DE MATRICES Y REPLICACIÓN
DISPOSICIÓN DE MATRICES
SIEMBRA Y ESTRIADO
AGAR A AGAR
INTEGRACIÓN DE ROBÓTICA
INCUBADOR CON AGITACIÓN
MANIPULACIÓN DE LÍQUIDOS
PCR
SELLADOR/ABRIDOR DE PLACAS
ELISA
CAPACIDAD PARA PLACAS DE DESTINO
APILADORES
CAPACIDAD PARA PLACAS DE ORIGEN
TIEMPO SIN INTERVENCIÓN DEL USUARIO

Diseño básico para la automatización de la selección de colonias con un tamaño reducido. Sistema ideal para sustituir la selección manual por automática que permite una configuración del soporte de placas y uso de material de laboratorio flexibles.

Desde la siembra en placas a la selección: incremento del rendimiento con hasta 210 placas de destino en tres líneas de apiladores. La fluídica opcional para la siembra y estriado le permite sembrar y seleccionar muestras.

El sistema de selección de colonias y gestión de bibliotecas flexible, modular y completamente automatizado está listo para la integración de robótica para conseguir el máximo rendimiento y tiempo sin intervención del usuario.

Luz blanca y fluorescencia.

Luz blanca y fluorescencia.

Luz blanca y fluorescencia.

3000 colonias por hora en luz blanca, 2000 colonias por hora en luz fluorescente

3000 colonias por hora en luz blanca, 2000 colonias por hora en luz fluorescente

3000 colonias por hora en luz blanca, 2000 colonias por hora en luz fluorescente

Tamaño, proximidad, redondez e intensidad de fluorescencia.

Tamaño, proximidad, redondez e intensidad de fluorescencia.

Tamaño, proximidad, redondez e intensidad de fluorescencia.

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Solo QPix 460

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Selección: 12 plates
Replicating and re-arraying: Máximo de 20 posiciones de placas

QPix 450: Hasta 156 placas SBS estándar, 52 placas SBS estándar por apilador, hasta 3 líneas de apiladores.

QPix 460: Hasta 104 placas SBS estándar, 52 placas SBS estándar por apilador, hasta 2 líneas de apiladores.

Configurable y ampliable con automatización. Sin límite en el número de placas.

Hecho

2 o 3 líneas de apiladores

Alojamientos para placas

Sin intervención manual:
1 placa de Petri de 15 cm;
5 placas de Petri de 9 cm;
2 OmniTrays;
1 QTrays de 22 cm

Sin intervención manual:
2 placa de Petri de 15 cm;
10 placas de Petri de 9 cm;
4 OmniTrays;
2 QTrays de 22 cm

Modo de automatización:
1-well Omnitray,
8-well Omnitray
Manual mode:
Qtrays
Placas de Petri
Omnitrays
Placas SBS

25 minutos cada vez: solo hay que volver para retirar las placas de destino después de que se haya llenado con 12

QPix 450: 156 placas x 96 colonias por placa = 14 976 colonias seleccionadas en 4,5 horas

QPix 460: 104 placas x 96 colonias por placa = 9​984 colonias seleccionadas en 3 horas

La duración completa del ciclo

Recursos más recientes

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Aplicaciones de los selectores de colonias microbianas QPix serie 400

  • Zona de inhibición antibiótica

    Uso del software QPix para zona de inhibición antibiótica

    La eficacia de una cepa bacteriana productora de antibiótico sobre otra cepa bacteriana específica se puede determinar midiendo el tamaño de la zona de aclaramiento que produce sobre un césped de bacterias. El software QPix le permite identificar, clasificar y seleccionar rápidamente las colonias microbianas que producen zonas de aclaramiento. El análisis inteligente de las imágenes permite la medición de zonas de aclaramiento dentro de un césped de bacterias y su clasificación en función del tamaño de la colonia, el diámetro del halo y la compactación.

    Biocombustibles

    Detección de biocombustibles en los selectores de colonias QPix

    Uno de los recursos de energía alternativa más importante es el biodiésel, un combustible portátil altamente energético compuesto principalmente de triacilgliceroles. La producción de biodiésel a partir de sistemas microbianos productores de lípidos implica el cribado de miles de clones mediante una multitud de pruebas como los ensayos de ácido bicincónico (BCA), mediciones de la densidad óptica y ensayos de cromatografía de gases. Los selectores de colonias QPix automatizan la tarea de selección de colonias, un proceso laborioso y propenso a errores, acortando de forma eficiente el tiempo hasta encontrar candidatos adecuados.

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  • Cribado azul/blanco

    Cribado azul/blanco con QPix 400

    El cribado de transformantes bacterianos que contienen plásmidos recombinantes con insertos de genes clonados es un paso esencial en la clonación molecular. El método de indicador colorimétrico denominado “cribado azul/blanco” permite la identificación fácil de colonias recombinantes y no recombinantes en función del color. Los selectores de colonias QPix ofrecen una solución automatizada diseñada especialmente para un exacto cribado colorimétrico azul/blanco utilizando la adquisición de imágenes de luz blanca para monitorizar de forma eficaz la eficiencia de la transformación. También se pueden implementar en los sistemas otros métodos colorimétricos, como el “cribado rojo/blanco”. 

    Leer nota de aplicación 

    Secuenciación de ADN

    Secuenciación de ADN con QPix

    La secuenciación es la lectura del orden preciso de los nucleótidos adenina (A), guanina (G), citosina (C) y timina (T) en una molécula de ADN. La secuenciación “shotgun” es un método en el que el ADN se fragmenta en trozos de una kilobase y posteriormente se subclonan en plásmidos circulares y se transfectan a bacterias. La selección automática de colonias es esencial para incrementar el rendimiento y el aislamiento de los plásmidos para la secuenciación. Los selectores de colonias QPix son conocidos por su fiabilidad y exactitud y se utilizaron en muchos centros de secuenciación durante el Proyecto Genoma Humano. Muchas áreas de investigación, como el desarrollo de vacunas, continúan utilizando técnicas de secuenciación tradicionales.

    Leer nota de aplicación 

  • Anticuerpos monoclonales (AcM)

    Anticuerpos monoclonales (AcM)

    Los anticuerpos monoclonales (AcM) se originan a partir de una única célula parental, por lo que se unen exclusivamente a un único epítopo. El descubrimiento de anticuerpos normalmente hace referencia al cribado e identificación de anticuerpos específicos que reconocen un epítopo específico para el diagnóstico y tratamiento de enfermedades, como el coronavirus para la COVID-19.

    Más información 

    Despliegue de fagos

    Técnica de despliegue de fagos con los selectores de colonias QPix

    El despliegue de fagos es una técnica que permite el estudio de la interacción de proteínas, péptidos o el ADN con una proteína diana. Esta herramienta molecular permite el descubrimiento de ligandos de alta afinidad mediante el uso de bacteriófagos para presentar una proteína diana en el exterior de la cubierta vírica, a la vez que contiene dentro de la cubierta vírica el ADN que codifica la proteína diana. Los fagos desplegados resultantes se puede cribar en función de su unión frente a una biblioteca de péptidos o proteínas en un formato de alto rendimiento. Los selectores de colonias QPix se pueden usar para automatizar la inoculación, siembra, extensión y selección en un flujo de trabajo de despliegue de fagos.  

    Más información 

  • Evolución de proteínas

    Evolución de proteínas con los selectores de colonias microbianas

    La evolución de las proteínas describe los cambios a lo largo del tiempo en la forma, función y composición de las proteínas. La evolución dirigida de las proteínas ha demostrado ser una estrategia eficaz para alterar o mejorar la actividad de macromoléculas para aplicaciones industriales, de investigación y terapéuticas. Con varios filtros fluorescentes, el sistema es compatible con una gran variedad de vectores de clonación fluorescentes. Esto permite a los selectores de colonias QPix revelar información única sobre las colonias individuales cuando se estudia el pliegue de proteínas, la evolución de enzimas y la localización de proteínas. Esto incluye la búsqueda de marcadores de transformación y el cribado de mutaciones.

    Biología sintética

    Biología sintética

    La biología sintética es un término amplio que hace referencia a la manipulación de vías genéticas para aprovechar el poder de los sistemas biológicos existentes en nuevas vías (a menudo para producir moléculas o proteínas). La biología sintética aplica a sistemas biológicos principios que proceden de ingeniería, específicamente ciclos de diseño-construcción-prueba-aprendizaje. Aprovechando los flujos de trabajo de alto rendimiento, los biólogos sintéticos pueden acelerar este proceso.

    Más información 

Especificaciones y opciones de los selectores de colonias microbianas QPix serie 400

Recursos de los selectores de colonias microbianas QPix serie 400

Presentaciones
Vídeos y seminarios web
Consejos para la automatización de aplicaciones de clonación molecular e ingeniería de cepas

Consejos para la automatización de aplicaciones de clonación molecular e ingeniería de cepas

Vídeo demo de QPix

Vídeo demo de QPix

Edinburgh Genome Foundry

Ver QPix en acción en Edinburgh Genome Foundry

Flujo de trabajo de inmunología y desarrollo de vacunas

Flujo de trabajo de inmunología y desarrollo de vacunas

SynBioBeta: grupo de debate sobre QPix 2020

SynBioBeta: grupo de debate sobre QPix 2020

Selección en placa

Selección en placa

Análisis filogenético metagenómico

Metagenómica sintética: conversión de la información digital de nuevo en biología

QPix 400

QPix 400

  • Citation
    Dated: Oct 28, 2014
    Publication Name: Front. Microbiol

    Impact of interspecific interactions on antimicrobial activity among soil bacteria

    Certain bacterial species produce antimicrobial compounds only in the presence of a competing species. However, little is known on the frequency of interaction-mediated induction of antibiotic compound production in natural communities of soil bacteria. Here we developed a high-throughput method to screen for the production of antimicrobial… View more

    Certain bacterial species produce antimicrobial compounds only in the presence of a competing species. However, little is known on the frequency of interaction-mediated induction of antibiotic compound production in natural communities of soil bacteria. Here we developed a high-throughput method to screen for the production of antimicrobial activity by monocultures and pair-wise combinations of 146 phylogenetically different bacteria isolated from similar soil habitats. Growth responses of two human pathogenic model organisms, Escherichia coli WA321 and Staphylococcus aureus 533R4, were used to monitor antimicrobial activity. From all isolates, 33% showed antimicrobial activity only in monoculture and 42% showed activity only when tested in interactions. More bacterial isolates were active against S. aureus than against E. coli. The frequency of interaction-mediated induction of antimicrobial activity was 6% (154 interactions out of 2798) indicating that only a limited set of species combinations showed such activity. The screening revealed also interaction-mediated suppression of antimicrobial activity for 22% of all combinations tested. Whereas all patterns of antimicrobial activity (non-induced production, induced production and suppression) were seen for various bacterial classes, interaction-mediated induction of antimicrobial activity was more frequent for combinations of Flavobacteria and alpha- Proteobacteria. The results of our study give a first indication on the frequency of interference competitive interactions in natural soil bacterial communities which may forms a basis for selection of bacterial groups that are promising for the discovery of novel, cryptic antibiotics.

    Contributors: Olaf Tyc, Marlies van den Berg, Saskia Gerards, Johannes A. van Veen, Jos M. Raaijmakers, Wietse de Boer, and Paolina Garbeva  
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  • Citation
    Dated: Mar 19, 2004
    Publication Name: The Journal of Biological Chemistry

    Improved Catalytic Efficiency and Active Site Modification of 1,4-β-D-Glucan Glucohydrolase A from Thermotoga neapolitana by Directed Evolution*

    Thermotoga neapolitana 1,4-β-D-glucan glucohydrolase A preferentially hydrolyzes cello-oligomers, such as cellotetraose, releasing single glucose moieties from the reducing end of the cello-oligosaccharide chain. Using directed evolution techniques of error-prone PCR and mutant library screening, a variant glucan glucohydrolase has been isolated… View more

    Thermotoga neapolitana 1,4-β-D-glucan glucohydrolase A preferentially hydrolyzes cello-oligomers, such as cellotetraose, releasing single glucose moieties from the reducing end of the cello-oligosaccharide chain. Using directed evolution techniques of error-prone PCR and mutant library screening, a variant glucan glucohydrolase has been isolated that hydrolyzes the disaccharide, cellobiose, at a 31% greater rate than its wild type (WT) predecessor. The mutant library, expressed in Escherichia coli, was screened at 85 °C for increased hydrolysis of cellobiose, a native substrate rather than a chromogenic analog, using a continuous, thermostable coupled enzyme assay. The Vmax for the mutant was 108 ± 3 units mg-1, whereas that of the WT was 75 ± 2 units mg-1. The Km for both proteins was nearly the same. The kcat for the new enzyme increased by 31% and its catalytic efficiency (kcat/Km) for cellobiose also rose by 31% as compared with the parent. The nucleotide sequence of two positive clones and two null clones identified 11 single base shifts. The nucleotide transition in the most active clone caused an isoleucine to threonine amino acid substitution at position 170. Structural models for I170T and WT proteins were derived by sequence homology with Protein Data Bank code 1BGA from Paenibacillus polymyxa. Analysis of the WT and I170T model structures indicated that the substitution in the mutant enzyme repositioned the conserved catalytic residue Asn-163 and reconfigured entry to the active site.

    Contributors: James K. McCarthy, Aleksandra Uzelac, Diane F. Davis and Douglas E. Eveleigh  
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  • Citation
    Dated: Aug 21, 2003
    Publication Name: the plant journal

    The transcriptional response of Arabidopsis to genotoxic stress – a high‐density colony array study (HDCA)

    A genome‐wide transcription profiling of Arabidopsis upon genotoxic stress has been performed using a high‐density colony array (HDCA). The array was based on a library of 27 000 cDNA clones derived from Arabidopsis cells challenged with bleomycin plus mitomycin C. The array covers more than 10 000 individual genes (corresponding to at least 40%… View more

    A genome‐wide transcription profiling of Arabidopsis upon genotoxic stress has been performed using a high‐density colony array (HDCA). The array was based on a library of 27 000 cDNA clones derived from Arabidopsis cells challenged with bleomycin plus mitomycin C. The array covers more than 10 000 individual genes (corresponding to at least 40% of Arabidopsis genes). After hybridisation of the HDCA with labelled cDNA probes obtained from genotoxin‐treated (bleomycin plus mitomycin C, 6 h) and untreated seedlings, 39 genes revealed an increased and 24 genes a decreased expression among the 3200 highly expressed clones (representing approximately 1200 individual genes because of redundancy of the cDNA library). Of the 4900 clones with a low transcriptional level, the expression of 500 clones was found to be altered and 57 genes with increased and 22 genes with decreased expression were identified by sequence analysis of 135 identified clones. The HDCA results were validated by real‐time PCR analysis. For about 80% of genes (34 out of 42), alteration in expression was confirmed, indicating the reliability of the HDCA for transcription profiling. DNA damage and stress‐responsive genes encoding, for instance transcription factors (myb protein and WRKY1), the ribonucleotide reductase small subunit (RNR2), thymidine kinase (TK), an AAA‐type ATPase, the small subunit of a DNA polymerase and a calmodulin‐like protein were found to be strongly upregulated. Also, several genes involved in cell cycle regulation revealed significant alteration in transcription, as detected by real‐time PCR analysis, suggesting disturbance of cell cycle progression by mutagen treatment.

    Contributors: I‐Peng Chen, Urs Haehnel, Lothar Altschmied, Ingo Schubert, Holger Puchta  
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