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Adquisición selectiva de imágenes QuickID

Adquisición selectiva QuickID

 

La adquisición selectiva QuickID funciona adquiriendo un campo visual (field-of-view, FoV) completo de una muestra a bajo aumento, busca objetos de interés o eventos raros mediante un proceso de análisis rápido de la imagen y luego vuelve a adquirir solo estos pocillos o sitios a gran aumento con un protocolo configurado por el usuario que puede incluir las longitudes de onda, Z-stacks y puntos temporales de interés.

La adquisición selectiva de imágenes se realiza con el software MetaXpress y se puede utilizar con los sistemas de adquisición de imágenes de alto contenido ImageXpress.

quickid selectiva

 

Aumente la eficiencia de la adquisición de imágenes con la adquisición selectiva QuickID

 

Los investigadores que realizan cribados de alto contenido basados en imágenes pueden enfrentarse a varios problemas técnicos si tienen que adquirir imágenes de sus muestras a alta resolución, a varias longitudes de onda y sobre un rango de planos Z. Dichos experimentos a menudo tienen tiempos de adquisición largos (entre varias horas y un par de días) y la necesidad de mucho espacio de almacenamiento de imágenes (cientos de GB) y de un equipo informático de alta potencia para que el tiempo de análisis de las imágenes sea manejable (cuanto menos horas, mejor).

Una forma sencilla de minimizar todos estos problemas es adquirir solo los campos visuales del portaobjetos o microplaca que contenga los objetos de interés. Esta técnica puede ser especialmente útil cuando el objeto de interés es poco abundante en cada muestra, distribuido aleatoriamente en el espacio o solo se produce como un evento raro en algunos de los pocillos. Esta solución, cuando se utiliza con nuestros sistemas de adquisición de imágenes de alto contenido y el software de análisis de imágenes, reduce considerablemente el tiempo hasta la obtención del resultado, así como los requisitos de almacenamiento de imágenes.

 

Adquiera datos 10 veces más rápido a partir de cultivos celulares 3D

En la nota de aplicación “Adquiera datos de 10 veces más rápido a partir de esferoides 3D cultivados usando Symphony® y VersaGel®” se usó un hidrogel fotorreticulable como matriz para cultivar 1-4 esferoides/pocillo en un espacio 3D. Tras la tinción, se llevó a cabo la adquisición QuickID usando un objetivo 2X para capturar el pocillo completo en un único campo visual. Se identificaron los objetos de interés y se referenciaron automáticamente sus coordenadas X e Y para que el sistema ImageXpress Micro obtuviera únicamente las imágenes relevantes a un aumento de 10X con tres longitudes de onda en múltiples planos Z. Con QuickID, el tiempo de adquisición fue 10 veces más corto en comparación con la adquisición de imágenes de todos los sitios de cada pocillo con un gran aumento y esto también reduce 20 veces el espacio de almacenamiento necesario.

 

Cultivos celulares 3D

 

Se utilizó QuickID para optimizar la adquisición de imágenes de esferoides. Se utilizó una imagen adquirida a bajo aumento para ver el pocillo completo en un único campo visual para identificar objetos que permitan repetir la adquisición de imágenes automáticamente a mayor aumento con tres longitudes de onda en múltiples planos Z.

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Adquiera imágenes automáticamente de esferoides 3D en el centro del campo visual

Existen varios métodos para cultivar esferoides para el cribado de fármacos antitumorales. En algunos formatos, los esferoides no siempre están centrados en el pocillo, lo que puede dificultar la adquisición del objeto de interés en un único campo visual (FoV) a gran aumento. QuickID nos permitió adquirir imágenes automáticamente de cada esferoide en el centro del FoV usando un objetivo de inmersión en agua 20X para obtención Z-stacks con varias longitudes de onda sin adquirir sitios adicionales.

QuickID selectiva

La adquisición QuickID se realizó con un objetivo 10X para obtener imágenes rápidamente de una microplaca completa. Posteriormente, se identificaron los objetos esféricos y se utilizaron sus coordenadas X e Y para adquirir automáticamente solo los sitios que contenían un microtejido tumoral con un objetivo de inmersión en agua 20X con varias longitudes de onda y múltiples planos Z. Se realizó el análisis de las imágenes para encontrar y medir objetos dentro del volumen 3D.

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Otras aplicaciones para adquisición selectiva

QuickID optimiza el proceso de modo que solo se adquieren imágenes relevantes, lo que tiene como resultado un ahorro significativo de tiempo y menor necesidad de espacio de almacenamiento. Otras aplicaciones que podrían beneficiarse del uso de QuickID son, por ejemplo, la adquisición de células vivas en división u organismos modelo, y adquisición de imágenes de áreas específicas de cortes de tejido en un portaobjetos.

 

  • Huso mitótico

    Huso mitótico

    En una población de células normales, solo el 1-5 % de las células están en mitosis. La adquisición selectiva se puede utilizar para identificar estas células en la población completa y posteriormente seguirlas a lo largo del tiempo con gran aumento. Es posible rastrear y volver a centrar células individuales si se mueven fuera de la región durante el transcurso del tiempo de adquisición.

    Microesferoides 3D

    Microesferoides 3D

    Los microesferoides a menudo se acumulan en el borde a las placas de fondo plano. Puede realizarse una adquisición inicial con luz transmitida seguida de una adquisición selectiva de Z-stacks de marcadores fluorescentes para reducir en gran medida el número de imágenes necesarias.

  • Hipocampo en un corte de cerebro

    Hipocampo en un corte de cerebro

    Dependiendo de la morfología de la muestra y de su preparación, el hipocampo y otras partes del cerebro podrían estar en varias áreas en un portaobjetos. La adquisición selectiva de Z-stacks se puede realizar a varias longitudes de onda para el estudio de colocalización.

    Latido del corazón en pez cebra

    Latido del corazón en pez cebra

    La posición y orientación de un pez cebra en un pocillo puede variar. Las adquisiciones de Z-stacks y de lapso de tiempo a gran aumento del corazón, ojo, cerebro, saco vitelino, iridóforos o vasos sanguíneos se pueden realizar usando la adquisición selectiva.

  • Micronuclei

    Micronuclei

    A bajos aumentos, es difícil determinar con exactitud si un objeto es realmente un micronúcleo o simplemente es un artefacto. La readquisición selectiva a gran aumento puede ayudar a reducir el número de falsos positivos.

Recursos más recientes

Recursos para la adquisición selectiva de imágenes QuickID